果酸对一些角质异常的皮肤病有治疗上的意义。像最早应用於鱼鳞癣类皮肤病、角化性的老人斑及疣。或是辅助治疗青春痘的肌肤作为减少毛孔角栓的形成。

果酸再皮肤科学上的应用因浓度不同而稍有差异。一般而言，低PH及游离酸浓度越高，效果越显著，但是发生副作用的机会也相对增加。再低浓度时，它是一种保湿剂，可增加角质的含水量，也可以破坏角质层细胞的凝聚力，有柔软角质、去角质的作用，促进皮肤的新陈代谢。在高浓度下，它的破坏力就较大，会造成角质剥落、表皮剥离，称做化学换肤（或称化学磨皮）。另外可以促进真皮层胶原蛋白与黏多醣体的再生，使皮肤变得较光滑有弹性，甚至使较细的皱纹变得不明显。

果酸虽然是美容圣品，但也可能产生副作用。特别是敏感型皮肤的人或是刚开始使用的人，会发生不同程度的刺痛、发红、痒、脱皮等不适的症状，甚至会暂时增加色素沉著。使用果酸保养品时，可以由较低度开始，让皮肤渐渐地对果酸适应，增加对果酸的耐受性，隔一段时间再嚐试较高一点浓度的果酸。其他要注意的是使用果酸时，皮肤因为角质层变薄，有可能对一些外来刺激较敏感，如日晒、风吹及一些含酒精成份的化妆品等。故一些保护措施，如避免晒太阳或适时使用防晒乳液等。

传统使用石碳酸（Phenol）或三氯醋酸（Trichloroacetic acid；TCA）做化学换肤虽然效果较快，但换肤的深度较难控制，且石碳酸有可能经由皮肤吸收产生肾毒性；故现今使用的高浓度果酸做换肤，较一般传统的换肤术既安全又有效。

果酸换肤
在早期果酸主要是被当作保湿剂使用和用来调整化妆品的酸碱值，後来发现水果酸功效的是Eugene Van Scott，分别在1976年与Ruey J. Yu申请专利，主要应用於调理乾性肌肤，後来用於治疗青春痘、老人斑。直到1990年在市场才有商品问世。依据卫生署公布含果酸及相关成份的化妆品，其酸碱值不可低於3.5。

果酸换肤最初的设计是给鱼鳞癣的患者使用的，因为果酸的特性是能帮助的皮肤剥离过度角化的角质，直到运用於一般正常肌肤由浅层的加速代谢保养品，至深层的果酸换肤术。